Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms