Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Chchd5Q9CQP3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms