Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc2Q9CQP2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms