Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM1

Type III endosome membrane protein TEMP, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQM1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQM1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQM1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQM1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQM1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQM1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQM1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQM1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQM1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQM1 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQM1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms