Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms