Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms