Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ6

Denr, Density-regulated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DenrQ9CQJ6 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms