Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nudt21Q9CQF3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nudt21Q9CQF3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nudt21Q9CQF3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Nudt21Q9CQF3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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