Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms