Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Atp6v0e1Q9CQD8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Atp6v0e1Q9CQD8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Atp6v0e1Q9CQD8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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