Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

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Length 51 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl39lQ9CQD0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl39lQ9CQD0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl39lQ9CQD0 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl39lQ9CQD0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl39lQ9CQD0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl39lQ9CQD0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl39lQ9CQD0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl39lQ9CQD0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl39lQ9CQD0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl39lQ9CQD0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl39lQ9CQD0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl39lQ9CQD0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Rpl39lQ9CQD0 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Rpl39lQ9CQD0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Rpl39lQ9CQD0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl39lQ9CQD0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl39lQ9CQD0 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Rpl39lQ9CQD0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Rpl39lQ9CQD0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Rpl39lQ9CQD0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Rpl39lQ9CQD0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Rpl39lQ9CQD0 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Rpl39lQ9CQD0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl39lQ9CQD0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl39lQ9CQD0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl39lQ9CQD0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl39lQ9CQD0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
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Rpl39lQ9CQD0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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