Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms