Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Use1Q9CQ56 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Use1Q9CQ56 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Use1Q9CQ56 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Use1Q9CQ56 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms