Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms