Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ1

Ccdc198, Uncharacterized protein CCDC198, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc198Q9CPZ1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms