Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms