Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Krt88Q9CPR6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Krt88Q9CPR6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Krt88Q9CPR6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Krt88Q9CPR6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Krt88Q9CPR6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Krt88Q9CPR6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Krt88Q9CPR6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Krt88Q9CPR6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Krt88Q9CPR6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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