Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rrbp1Q99PL5 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms