Protein–RNA interactions for Protein: Q99PJ2

Trim8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim8Q99PJ2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms