Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GpnmbQ99P91 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms