Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms