Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms