Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brms1Q99N20 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brms1Q99N20 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brms1Q99N20 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brms1Q99N20 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
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Brms1Q99N20 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Brms1Q99N20 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brms1Q99N20 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Brms1Q99N20 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Brms1Q99N20 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Brms1Q99N20 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brms1Q99N20 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brms1Q99N20 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brms1Q99N20 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brms1Q99N20 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brms1Q99N20 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Brms1Q99N20 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Brms1Q99N20 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brms1Q99N20 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Brms1Q99N20 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brms1Q99N20 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
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Brms1Q99N20 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Brms1Q99N20 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brms1Q99N20 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Brms1Q99N20 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms