Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tdrd1Q99MV1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tdrd1Q99MV1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tdrd1Q99MV1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tdrd1Q99MV1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tdrd1Q99MV1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tdrd1Q99MV1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tdrd1Q99MV1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tdrd1Q99MV1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tdrd1Q99MV1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tdrd1Q99MV1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tdrd1Q99MV1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tdrd1Q99MV1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tdrd1Q99MV1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tdrd1Q99MV1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tdrd1Q99MV1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tdrd1Q99MV1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tdrd1Q99MV1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tdrd1Q99MV1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tdrd1Q99MV1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms