Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR8

Mccc1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc1Q99MR8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mccc1Q99MR8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms