Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrrtQ99MR6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms