Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtpbp4Q99ME9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtpbp4Q99ME9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtpbp4Q99ME9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtpbp4Q99ME9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtpbp4Q99ME9 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtpbp4Q99ME9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtpbp4Q99ME9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtpbp4Q99ME9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtpbp4Q99ME9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtpbp4Q99ME9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtpbp4Q99ME9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtpbp4Q99ME9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtpbp4Q99ME9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtpbp4Q99ME9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtpbp4Q99ME9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtpbp4Q99ME9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtpbp4Q99ME9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtpbp4Q99ME9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtpbp4Q99ME9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtpbp4Q99ME9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtpbp4Q99ME9 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtpbp4Q99ME9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtpbp4Q99ME9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtpbp4Q99ME9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtpbp4Q99ME9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtpbp4Q99ME9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtpbp4Q99ME9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtpbp4Q99ME9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtpbp4Q99ME9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtpbp4Q99ME9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtpbp4Q99ME9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtpbp4Q99ME9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtpbp4Q99ME9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtpbp4Q99ME9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtpbp4Q99ME9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtpbp4Q99ME9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtpbp4Q99ME9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtpbp4Q99ME9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtpbp4Q99ME9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtpbp4Q99ME9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtpbp4Q99ME9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtpbp4Q99ME9 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtpbp4Q99ME9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtpbp4Q99ME9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtpbp4Q99ME9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtpbp4Q99ME9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtpbp4Q99ME9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtpbp4Q99ME9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtpbp4Q99ME9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtpbp4Q99ME9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtpbp4Q99ME9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtpbp4Q99ME9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtpbp4Q99ME9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtpbp4Q99ME9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtpbp4Q99ME9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtpbp4Q99ME9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtpbp4Q99ME9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms