Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms