Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME3

Sncaip, Synphilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaipQ99ME3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SncaipQ99ME3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms