Protein–RNA interactions for Protein: Q99M28

Rnps1, RNA-binding protein with serine-rich domain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnps1Q99M28 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnps1Q99M28 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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