Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms