Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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Sh3bp5lQ99LH9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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Sh3bp5lQ99LH9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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Sh3bp5lQ99LH9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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Sh3bp5lQ99LH9 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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Sh3bp5lQ99LH9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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Sh3bp5lQ99LH9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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Sh3bp5lQ99LH9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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Sh3bp5lQ99LH9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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Sh3bp5lQ99LH9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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Sh3bp5lQ99LH9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sh3bp5lQ99LH9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sh3bp5lQ99LH9 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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Sh3bp5lQ99LH9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp5lQ99LH9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp5lQ99LH9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp5lQ99LH9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp5lQ99LH9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp5lQ99LH9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp5lQ99LH9 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp5lQ99LH9 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp5lQ99LH9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp5lQ99LH9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp5lQ99LH9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp5lQ99LH9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp5lQ99LH9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp5lQ99LH9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp5lQ99LH9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp5lQ99LH9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp5lQ99LH9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp5lQ99LH9 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp5lQ99LH9 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp5lQ99LH9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp5lQ99LH9 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp5lQ99LH9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp5lQ99LH9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp5lQ99LH9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
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