Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms