Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms