Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms