Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn2aQ99KJ0 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn2aQ99KJ0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn2aQ99KJ0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn2aQ99KJ0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn2aQ99KJ0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn2aQ99KJ0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn2aQ99KJ0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn2aQ99KJ0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn2aQ99KJ0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn2aQ99KJ0 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn2aQ99KJ0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn2aQ99KJ0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn2aQ99KJ0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn2aQ99KJ0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn2aQ99KJ0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn2aQ99KJ0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn2aQ99KJ0 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn2aQ99KJ0 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn2aQ99KJ0 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn2aQ99KJ0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn2aQ99KJ0 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn2aQ99KJ0 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn2aQ99KJ0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn2aQ99KJ0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn2aQ99KJ0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn2aQ99KJ0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn2aQ99KJ0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn2aQ99KJ0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn2aQ99KJ0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn2aQ99KJ0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn2aQ99KJ0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn2aQ99KJ0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn2aQ99KJ0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn2aQ99KJ0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn2aQ99KJ0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn2aQ99KJ0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn2aQ99KJ0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn2aQ99KJ0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn2aQ99KJ0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn2aQ99KJ0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn2aQ99KJ0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn2aQ99KJ0 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn2aQ99KJ0 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn2aQ99KJ0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn2aQ99KJ0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn2aQ99KJ0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn2aQ99KJ0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn2aQ99KJ0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn2aQ99KJ0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn2aQ99KJ0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn2aQ99KJ0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ubxn2aQ99KJ0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ubxn2aQ99KJ0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ubxn2aQ99KJ0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ubxn2aQ99KJ0 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubxn2aQ99KJ0 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubxn2aQ99KJ0 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubxn2aQ99KJ0 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubxn2aQ99KJ0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubxn2aQ99KJ0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubxn2aQ99KJ0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubxn2aQ99KJ0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubxn2aQ99KJ0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubxn2aQ99KJ0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubxn2aQ99KJ0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubxn2aQ99KJ0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn2aQ99KJ0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn2aQ99KJ0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn2aQ99KJ0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn2aQ99KJ0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn2aQ99KJ0 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn2aQ99KJ0 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn2aQ99KJ0 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn2aQ99KJ0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn2aQ99KJ0 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn2aQ99KJ0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn2aQ99KJ0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn2aQ99KJ0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn2aQ99KJ0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn2aQ99KJ0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn2aQ99KJ0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn2aQ99KJ0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn2aQ99KJ0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn2aQ99KJ0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn2aQ99KJ0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn2aQ99KJ0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn2aQ99KJ0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn2aQ99KJ0 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn2aQ99KJ0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn2aQ99KJ0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn2aQ99KJ0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn2aQ99KJ0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn2aQ99KJ0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms