Protein–RNA interactions for Protein: Q99K51

Pls3, Plastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pls3Q99K51 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pls3Q99K51 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pls3Q99K51 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pls3Q99K51 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pls3Q99K51 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pls3Q99K51 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pls3Q99K51 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pls3Q99K51 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pls3Q99K51 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pls3Q99K51 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pls3Q99K51 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms