Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlgn1Q99K10 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlgn1Q99K10 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlgn1Q99K10 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlgn1Q99K10 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlgn1Q99K10 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlgn1Q99K10 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlgn1Q99K10 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlgn1Q99K10 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlgn1Q99K10 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlgn1Q99K10 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlgn1Q99K10 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlgn1Q99K10 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlgn1Q99K10 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlgn1Q99K10 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlgn1Q99K10 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlgn1Q99K10 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlgn1Q99K10 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlgn1Q99K10 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlgn1Q99K10 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlgn1Q99K10 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlgn1Q99K10 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlgn1Q99K10 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlgn1Q99K10 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlgn1Q99K10 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlgn1Q99K10 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlgn1Q99K10 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlgn1Q99K10 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlgn1Q99K10 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlgn1Q99K10 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlgn1Q99K10 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlgn1Q99K10 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlgn1Q99K10 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlgn1Q99K10 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlgn1Q99K10 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlgn1Q99K10 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlgn1Q99K10 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlgn1Q99K10 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlgn1Q99K10 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlgn1Q99K10 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlgn1Q99K10 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlgn1Q99K10 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlgn1Q99K10 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlgn1Q99K10 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlgn1Q99K10 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlgn1Q99K10 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlgn1Q99K10 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlgn1Q99K10 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlgn1Q99K10 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlgn1Q99K10 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlgn1Q99K10 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlgn1Q99K10 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlgn1Q99K10 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlgn1Q99K10 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlgn1Q99K10 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlgn1Q99K10 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlgn1Q99K10 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlgn1Q99K10 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Nlgn1Q99K10 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlgn1Q99K10 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms