Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Lims1Q99JW4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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