Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlcd1Q99JT6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlcd1Q99JT6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlcd1Q99JT6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlcd1Q99JT6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlcd1Q99JT6 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlcd1Q99JT6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlcd1Q99JT6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlcd1Q99JT6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlcd1Q99JT6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlcd1Q99JT6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlcd1Q99JT6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlcd1Q99JT6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlcd1Q99JT6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlcd1Q99JT6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlcd1Q99JT6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlcd1Q99JT6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlcd1Q99JT6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlcd1Q99JT6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlcd1Q99JT6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlcd1Q99JT6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlcd1Q99JT6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlcd1Q99JT6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlcd1Q99JT6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlcd1Q99JT6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlcd1Q99JT6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlcd1Q99JT6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlcd1Q99JT6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlcd1Q99JT6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlcd1Q99JT6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlcd1Q99JT6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlcd1Q99JT6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlcd1Q99JT6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlcd1Q99JT6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlcd1Q99JT6 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlcd1Q99JT6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlcd1Q99JT6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tlcd1Q99JT6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tlcd1Q99JT6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tlcd1Q99JT6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tlcd1Q99JT6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tlcd1Q99JT6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlcd1Q99JT6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlcd1Q99JT6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlcd1Q99JT6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlcd1Q99JT6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlcd1Q99JT6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlcd1Q99JT6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlcd1Q99JT6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlcd1Q99JT6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlcd1Q99JT6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlcd1Q99JT6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlcd1Q99JT6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlcd1Q99JT6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlcd1Q99JT6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlcd1Q99JT6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlcd1Q99JT6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlcd1Q99JT6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlcd1Q99JT6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlcd1Q99JT6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlcd1Q99JT6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlcd1Q99JT6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlcd1Q99JT6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlcd1Q99JT6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlcd1Q99JT6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlcd1Q99JT6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlcd1Q99JT6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlcd1Q99JT6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlcd1Q99JT6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tlcd1Q99JT6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tlcd1Q99JT6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tlcd1Q99JT6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tlcd1Q99JT6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tlcd1Q99JT6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tlcd1Q99JT6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tlcd1Q99JT6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tlcd1Q99JT6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tlcd1Q99JT6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tlcd1Q99JT6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tlcd1Q99JT6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tlcd1Q99JT6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tlcd1Q99JT6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tlcd1Q99JT6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tlcd1Q99JT6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tlcd1Q99JT6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tlcd1Q99JT6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tlcd1Q99JT6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tlcd1Q99JT6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tlcd1Q99JT6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tlcd1Q99JT6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tlcd1Q99JT6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tlcd1Q99JT6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tlcd1Q99JT6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tlcd1Q99JT6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tlcd1Q99JT6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tlcd1Q99JT6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tlcd1Q99JT6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tlcd1Q99JT6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tlcd1Q99JT6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tlcd1Q99JT6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms