Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153.5 ms