Protein–RNA interactions for Protein: Q99J36

Thumpd1, THUMP domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd1Q99J36 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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