Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ophn1Q99J31 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ophn1Q99J31 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ophn1Q99J31 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ophn1Q99J31 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ophn1Q99J31 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ophn1Q99J31 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ophn1Q99J31 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ophn1Q99J31 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms