Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim11aQ99J19 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms