Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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