Protein–RNA interactions for Protein: Q924W9

Lmo1, Rhombotin-1, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo1Q924W9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Lmo1Q924W9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Lmo1Q924W9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Lmo1Q924W9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lmo1Q924W9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lmo1Q924W9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lmo1Q924W9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lmo1Q924W9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lmo1Q924W9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Lmo1Q924W9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Lmo1Q924W9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lmo1Q924W9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Lmo1Q924W9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lmo1Q924W9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms