Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smarca5Q91ZW3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms