Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms