Protein–RNA interactions for Protein: Q91YE8

Synpo2, Synaptopodin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Synpo2Q91YE8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Synpo2Q91YE8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Synpo2Q91YE8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Synpo2Q91YE8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Synpo2Q91YE8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Synpo2Q91YE8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Synpo2Q91YE8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Synpo2Q91YE8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Synpo2Q91YE8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Synpo2Q91YE8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Synpo2Q91YE8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Synpo2Q91YE8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Synpo2Q91YE8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Synpo2Q91YE8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Synpo2Q91YE8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Synpo2Q91YE8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Synpo2Q91YE8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Synpo2Q91YE8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Synpo2Q91YE8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Synpo2Q91YE8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Synpo2Q91YE8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Synpo2Q91YE8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Synpo2Q91YE8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Synpo2Q91YE8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Synpo2Q91YE8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Synpo2Q91YE8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Synpo2Q91YE8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Synpo2Q91YE8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Synpo2Q91YE8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Synpo2Q91YE8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Synpo2Q91YE8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Synpo2Q91YE8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Synpo2Q91YE8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Synpo2Q91YE8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Synpo2Q91YE8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Synpo2Q91YE8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Synpo2Q91YE8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Synpo2Q91YE8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Synpo2Q91YE8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Synpo2Q91YE8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Synpo2Q91YE8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Synpo2Q91YE8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Synpo2Q91YE8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Synpo2Q91YE8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Synpo2Q91YE8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Synpo2Q91YE8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Synpo2Q91YE8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Synpo2Q91YE8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Synpo2Q91YE8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Synpo2Q91YE8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Synpo2Q91YE8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Synpo2Q91YE8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Synpo2Q91YE8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Synpo2Q91YE8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Synpo2Q91YE8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Synpo2Q91YE8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Synpo2Q91YE8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Synpo2Q91YE8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Synpo2Q91YE8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Synpo2Q91YE8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Synpo2Q91YE8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms