Protein–RNA interactions for Protein: Q91XT4

Sec16b, Protein transport protein Sec16B, mousemouse

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec16bQ91XT4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec16bQ91XT4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms